Το σκότος έχει καταλάβει τη Νέα Υόρκη, καθώς ο δόλιος Σρέντερ και η συμμορία του ελέγχουν τα πάντα, από αστυνομία μέχρι πολιτικούς. Το μέλλον διαγράφεται ακόμα χειρότερο, μέχρι που μια παρέα από τους υπονόμους βγαίνει στην επιφάνεια κι αποδέχεται το πεπρωμένο της. Είναι οι τέσσερις χελώνες νίντζα. Αυτές πρέπει να συνεργαστούν με την ατρόμητη ρεπόρτερ Έιπριλ Ο`Νιλ και τον ευφυή κάμεραμαν της, Βερν Φένγουικ, για να αποκαλύψουν τα σχέδια του Σρέντερ και να σώσουν την πόλη.